屏東環保許可申請實務：總量管制、加嚴放流與農牧廠的三證

作者 Bo Wei・偉騰開發興業有限公司・發布 2026-09-03・更新 2026-09-03（由前臺東縣環境保護局局長謝清泉主持）

屏東與高雄同屬高屏空品總量管制區，武洛溪流域已發布加嚴放流水標準，畜牧與農產加工又是列管主力。本文以屏東縣政府環境保護局的科室分機、申辦表單、水污染管制區、飲用水水源水質保護區與三座產業園區等在地事實，整理水污、空污、廢清書三證在屏東的判定、時序與審查重點。

屏東的環保許可有三個在地脈絡要先記住：

1. 一是屏東縣與高雄市同屬環境部依《空氣污染防制法》第8條指定的高屏空品總量管制區，新設固定源要處理排放量認可與抵換；
2. 二是縣府於 115 年 1 月發布屏東縣武洛溪流域加嚴放流水標準，該流域的事業放流水標準比全國嚴；
3. 三是畜牧與農產加工廠是水污列管主力，沼渣沼液肥分使用與水污費徵收由水污染防治科專責承辦。

屏東縣政府環境保護局把三十四項表單及申辦流程放在同一頁，每一項都標了聯絡分機：事業廢棄物清理計畫書審查、公民營廢棄物處理機構申請、廢棄物清除許可、專責人員設置申請、水污染排放許可放流告示牌格式、地下水體貯存系統監測設備設置、崁頂焚化廠廢棄物進廠申請等。

環境部並自 114 年 1 月 1 日起在事業及污水下水道系統廢（污）水管理系統上線水污染防治許可證電子繳費功能。

偉騰開發興業由前臺東縣環境保護局局長帶隊，處理過屏東農產加工、畜牧與土石加工業的環保證照整隊，也熟悉高屏總量管制區的排放量帳怎麼算。以下依《水污染防治法》、《空氣污染防制法》與廢棄物清理制度的法定要件，逐節對照屏東環保局公開的窗口、公告與在地事實。

三證判定：法定公告、總量管制與屏東的水污染管制區

水污線依《水污染防治法》第13條與第14條：指定公告的事業於設立或變更前先送水污染防治措施計畫審查核准，排放廢（污）水於地面水體者要取得排放許可證或簡易排放許可文件並依登記事項運作；畜牧業屬第2條定義的事業，屏東環保局另公告畜牧業水污染防治措施計畫及許可申請表格式。

空污線依《空氣污染防制法》第24條，屏東環保局固定污染源專區列出第一批至第八批許可公告內容與排放量認可申請表單，後者是總量管制區既存源的義務。至於廢棄物線，關鍵在事業是否列入環境部公告應檢具事業廢棄物清理計畫書的範圍。

此外屏東縣已於 113 年 9 月公告水污染管制區並附禁止足使水污染行為附表，高屏溪流域另有水污染管制區公告，廠址落在管制區內，《水污染防治法》第30條各款禁止行為就直接適用。

屏東的窗口與分機：一頁申辦流程走完三證

屏東縣政府環境保護局設空氣污染防制科（含噪音與振動管制）、水污染防治科（含土壤及地下水污染整治、飲用水管理）、廢棄物管理科（含焚化廠、掩埋場管理）、綜合企劃科（環評、公害糾紛）與稽查科（違反環保法規案件之稽查、處分）。

表單及申辦流程頁載明各項分機：

• 廢清書審查分機 614、615；
• 公民營廢棄物處理機構申請與廢棄物清除許可分機 616；
• 營造業廢棄物管制編號分機 611；
• 專責人員設置申請分機 503 起；
• 水污染排放許可放流告示牌格式與加水站水源供應許可分機 503；
• 防止貯存系統污染地下水體設施及監測設備設置分機 513；
• 崁頂焚化廠廢棄物進廠申請分機 602；
• 環境影響評估審查作業流程分機 301。

縣府另有整合申辦入口可查環保局的民眾申辦項目。全國性線上系統為環境部環境保護許可管理資訊系統（EMS）與固定污染源管理資訊系統，屏東固定污染源專區附有操作說明。

空品在地事實：三級防制區、總量管制與空品維護區

依環境部 113 年 12 月 31 日公告、114 年 1 月 1 日生效的防制區圖說，屏東縣的 PM10、PM2.5 與臭氧八小時值皆屬三級防制區；環境部載明高屏地區空氣污染物總量管制計畫自 104 年實施以來涵蓋高雄市及屏東縣，屏東的洽詢窗口就是縣環保局。

兩層意義：

• 依《空氣污染防制法》第6條，三級防制區內新增或變更達一定規模的固定源應採最佳可行控制技術並經模式模擬；
• 依第8條，總量管制區內既存源應申請認可排放量並依指定目標削減，新設或變更達一定規模者應取得足供抵換新增排放量之排放量。

屏東在地管制主題還有河川揚塵（縣府設高屏溪揚塵預警通報資訊平台）、紙錢集中焚燒、露天燃燒（農業廢棄物清運管理作業平台）、餐飲業油煙與農耕機污染；屏東產業園區、屏南產業園區與屏南工業區已公告為空品維護區並實施移動污染源管制。

園區內設廠，車隊與機具也要一起算進合規清單。

水：加嚴放流水標準、飲用水保護區與畜牧廢水

屏東縣武洛溪流域加嚴放流水標準於 115 年 1 月發布，依《水污染防治法》第7條地方得就轄內水體加嚴放流水標準的授權訂定；流域內事業設計處理單元時，以加嚴值而非全國值為目標。飲用水水源水質保護區方面，屏東縣公告劃定牡丹水庫飲用水水源水質保護區，環境部劃定高屏溪飲用水及自來水水源水質保護區與高屏溪大樹攔河堰一定距離，選址時先查。

畜牧廢水是屏東的主軸：環保局設畜牧糞尿沼渣沼液肥分使用計畫及畜牧業水污染防治費徵收專區，沼渣沼液肥分使用由水污染防治科承辦，水污費徵收另有專責分機，農牧媒合資訊在全國畜牧糞尿資源化網站。

廢水去向三選一：

• 屏東、內埔、屏南等產業園區內廠商循園區污水系統納管；
• 要排入灌溉排水者向農業部農田水利署屏東管理處申請搭排；
• 其餘自行處理後依放流水標準排放並取得排放許可。

廢棄物：崁頂焚化廠進廠、農業廢棄物三準則與非法棄置場址

屏東縣崁頂垃圾資源回收（焚化）廠訂有廢棄物進廠管理要點並已多次修訂，廢棄物進廠申請所需文件列在申辦流程頁；縣府另訂區域性垃圾焚化廠營運階段提供回饋金自治條例。廢清書導向環境部事業廢棄物申報及管理資訊系統，屏東事業廢棄物專區提供廢清書申辦流程及操作手冊、全國清除處理機構與再利用機構名單查詢、公民營處理機構申請手冊。

屏東的特色是農業廢棄物管理制度：農業廢棄物代工破碎輔導與管理準則、集中場管理準則、代清運管理準則三套並行，搭配農業廢棄物清運管理作業平台，農產加工廠的植物性下腳料在屏東有合法出路。環保局並公布屏東縣廢棄物非法棄置場址現況，分自行列管與環境部列管案件；土地出租給他人堆置，就是這份名單的候選人。

審查端在看什麼：排放量帳、加嚴標準與四類文件一致性

屏東審查端看空污案時，第一件事是總量管制區的排放量帳：既存源的認可排放量與削減進度、新增源的抵換來源，沒有排放量來源的設置許可無法核准；技術面則對照三級防制區的最佳可行控制技術要求。

看水污案時，先確認廠址是否在武洛溪流域加嚴範圍、水污染管制區或飲用水水源水質保護區內，再核對處理單元能否達到適用標準、放流口告示牌是否依環保局公告格式設置。看廢清書時，核對廢棄物種類是否對應製程，農業廢棄物是否走縣府三準則的合法途徑。三張證的製程、原物料、產能描述必須一致；畜牧場還多一份沼渣沼液肥分使用計畫要與水措計畫的水量對得起來。

失敗代價與跨程序連動

代價寫在母法：依《水污染防治法》第45條，未取得排放許可即排放，處新臺幣 6 萬元以上 600 萬元以下罰鍰，主管機關並應令事業全部停工或停業；畜牧業違反放流水標準依第40條處新臺幣六千元以上六十萬元以下罰鍰並限期改善、按次處罰。

依《空氣污染防制法》第63條，未取得許可證逕行設置或操作，工商廠、場處新臺幣 10 萬元以上 2,000 萬元以下罰鍰並令停工。屏東環保局稽查科二十四小時待命，報案專線 08000-66666 與 08-7351928，並負責追繳逾期罰鍰移送執行。

跨程序上，屏東環保局公告的土污法第8條、第9條指定事業清單提醒：加油站、金屬表面處理等公告事業在土地移轉、設立或歇業前還有土壤污染評估調查義務；農產加工廠若同時申請工廠登記或特定工廠登記，環保許可是會辦的前置條件。

自我檢查清單

• 對照三個公告判定要辦哪幾張證，畜牧場另依環保局公告格式準備畜牧業水措計畫與許可申請表
• 確認廠址是否在水污染管制區、武洛溪流域加嚴放流水標準範圍或牡丹水庫、高屏溪飲用水水源水質保護區內
• 新增固定源先盤點高屏總量管制區的排放量認可與抵換來源，再備最佳可行控制技術文件
• 定案廢水去向：產業園區污水系統納管、農田水利署屏東管理處搭排或自行放流
• 依表單及申辦流程頁的分機對接承辦人：廢清書 614、615，清除許可 616，專責人員 503，焚化廠進廠 602
• 農業廢棄物依縣府代工破碎、集中場、代清運三準則規劃去化，避免落入非法棄置場址名單
• 屬土污法公告事業者，同步準備土壤污染評估調查及檢測資料

常見錯誤

• 沿用全國放流水標準設計處理單元——武洛溪流域已加嚴，試車後才發現達不到標準
• 把屏東當一般縣市辦空污許可、沒盤點抵換排放量——總量管制區新增源沒有排放量來源，設置許可無法核准
• 畜牧場只辦沼渣沼液肥分使用計畫、忽略水措計畫與水污費——兩套文件的水量對不起來，被要求說明
• 農產加工廠的植物性下腳料任意堆置或交給無牌業者——屏東有農業廢棄物三準則與清運平台，走錯路就成非法棄置
• 園區設廠只顧固定源、忘了空品維護區的移動污染源管制——車隊與機具被開單，投產前先挨罰

官方參考資料

• 《水污染防治法》全文｜全國法規資料庫
• 《空氣污染防制法》全文｜全國法規資料庫
• 屏東縣政府環境保護局

常見問題

屏東 水污許可 放流水標準 跟別縣市一樣嗎？

不一定。屏東縣政府於 115 年 1 月發布屏東縣武洛溪流域加嚴放流水標準，這是依《水污染防治法》第7條地方得就轄內水體加嚴放流水標準的授權訂定；廠址在該流域者，處理單元要以加嚴值為設計目標。另外屏東縣已公告水污染管制區並附禁止行為附表，牡丹水庫與高屏溪也劃有飲用水水源水質保護區，送件前先確認廠址落在哪一區。

屏東 養豬場 環保許可 要辦什麼？

畜牧業是《水污染防治法》第2條定義的事業，要依第13條、第14條辦水污染防治措施計畫與排放許可（屏東環保局公告有畜牧業專用申請表格式），並依排放水質水量繳水污費；想把糞尿變肥分則走沼渣沼液肥分使用計畫，由環保局水污染防治科承辦，農牧媒合可用全國畜牧糞尿資源化網站。

畜牧業違反放流水標準依第40條處新臺幣六千元以上六十萬元以下罰鍰並限期改善。

屏東 設廠 空污許可 要買排放量嗎？

要先確認規模。

屏東縣與高雄市同屬環境部依《空氣污染防制法》第8條指定的高屏空品總量管制區，總量管制區內新設或變更達一定規模的固定源，除採最佳可行控制技術外，還要取得足供抵換新增排放量的排放量；既存源則應申請排放量認可並依指定目標削減。

屏東環保局固定污染源專區有排放量認可申請表單，設置許可前先把這筆帳算清楚。

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