南投環保許可申請實務：山城工廠的水污空污廢清書路線

作者 Bo Wei・偉騰開發興業有限公司・發布 2026-09-03・更新 2026-09-03（由前臺東縣環境保護局局長謝清泉主持）

南投的環保許可有一條很具體的流程：廢清書從環境部 EMS 取得管制編號、填基線資料、列印一式兩份加騎縫章、繳審查費、紙本送環保局收發室，環保局把每一步都寫在網頁上。本文以南投縣政府環境保護局的科室電話、申辦流程、烏溪與濁水溪流域、南崗與竹山產業園區等事實，整理三張環保許可在南投的判定與時序。

南投是沒有海岸線的山城，環保許可的主角不是石化與鋼鐵，而是金屬加工、土石加工、食品與畜牧。南投縣政府環境保護局的網頁載明，工廠異常排放是民眾陳情案件發生的主要原因，土石加工業管制則源於莫拉克颱風後河川疏濬與砂石車穿梭的年代。理解這個背景，就理解為什麼南投的固定污染源許可會每年抽查持證場所製程。

南投環保局把申辦流程寫得很細：廢清書要先在環境部環境保護許可管理資訊系統（EMS）取得管制編號、填報基線資料、進入許可申請，再列印一式兩份加騎縫章並用印、附設立證明文件、繳審查費後把紙本送到環保局收發室；公民營清除處理機構許可則明訂純展延審查 30 天、僅變更名稱地址負責人 45 天，補正期間不列入審查期限。

偉騰開發興業由前臺東縣環保局長帶隊，處理過南投金屬加工、木業與農產加工廠的環保證照與特定工廠登記整隊。以下依《水污染防治法》、《空氣污染防制法》與廢棄物清理制度的法定要件，逐節對照南投環保局公開的科室、流程、流域與產業事實，寫成一份可以直接照做的在地指南。

三證判定與南投的科室分工

水污這一線有兩道門：

1. 第一道是《水污染防治法》第13條的水污染防治措施計畫（設立或變更前送審核准），
2. 第二道是第14條的排放許可證或簡易排放許可文件（排入地面水體者取得後始得排放，且須依登記事項運作）。

空污線依《空氣污染防制法》第24條：指定公告的固定污染源於設置或變更前取得設置許可證、設置後取得操作許可證始得操作，南投環保局依固定污染源許可證管理辦法審查並每年抽查持證場所製程。廢棄物線依《廢棄物清理法》第31條第1項第1款與事業廢棄物清理計畫書審查管理辦法，公告事業應提廢清書。

南投環保局的分工：

• 水質保護科負責水污染防治、土壤及地下水污染整治與飲用水管理；
• 空氣汙染防制科負責空污防制、噪音與振動管制與空污費（設於縣立體育場，與局本部不同址）；
• 廢棄物管理科負責清除處理機構、再利用機構審核與事業廢棄物審核管理；
• 綜合計畫科負責環評、毒性及關注化學物質與民眾申請案件；
• 稽查科即陳情中心，負責陳情案件處理與公害糾紛調處。

廢清書的南投版流程：從管制編號到收發室

南投環保局把廢清書流程逐步寫出：

• 已有其他類別管制編號者填申請管制編號傳真單傳真環保局，全新申請者到 EMS 新申請管制編號；
• 取得後登入 EMS 完成基線資料填報與確認，再進入許可申請、變更或異動填寫廢清書；
• 列印一式兩份加騎縫章並用印，附設立證明文件影本，審查費以現金臨櫃行政科或郵政匯票繳納，紙本送環保局 C 棟二樓收發室或郵寄。

環保局提供管制編號、廢清書與專線三組諮詢電話，並附廢清書審查流程圖。看似瑣碎的步驟其實是審查端的核對清單：基線資料是後續每月申報與聯單比對的基準，填錯製程或產出量，往後每一期申報都會與基線對不上。許可審查費與證書費統一向行政科出納繳納或郵政劃撥，繳費憑證要跟著紙本一起送。

清除處理機構許可與繳費：審查天數寫在牆上

委託清運前，先確認清除處理機構的許可：

• 南投環保局載明清除機構送件兩份；
• 處理機構分兩階段，先取得同意設置文件（送十份、現勘會簽、技術審查會），試運轉後再申請處理許可證；
• 審查期限純展延 30 天、僅更動名稱地址負責人等變更 45 天，補正資料期間不限次數但不列入審查期限；
• 新設或涉及暫時貯存場、轉運站者需現場勘查會簽，線上系統為環境部清除處理機構服務管理資訊系統，審查費依公民營廢棄物清除處理機構申請許可案件收費標準。

產源廠的意義是：清運商的許可效期與許可項目要跟你的廢棄物代碼對得上，展延中的機構要看是否已依限送件。全國合格廠商可在環境部公民營清理機構查詢系統確認。

空品在地事實：三級防制區的規則與山城逸散源

依環境部 113 年 12 月 31 日公告、114 年 1 月 1 日生效的各級防制區劃定表，南投縣的 PM10、PM2.5 與臭氧皆屬三級防制區。

意義是：依《空氣污染防制法》第6條，三級防制區內既存固定污染源應削減排放量，新增或變更達一定規模的固定源應採最佳可行控制技術並經模式模擬證明不超過容許增量限值；南投不在高屏總量管制區內，沒有法定抵換義務，但技術與模擬要求全面適用。

南投環保局的管制重點包括土石加工業依固定污染源逸散性粒狀污染物空氣污染防制設施管理辦法設置防制設施並認養洗掃道路、加油站油氣回收、畜牧業、餐飲業油煙、營建空污費與街道揚塵、民生燃燒（餐飲、民俗、農業）煙霧管制；縣內設南投、竹山、埔里、草屯四處人工測站。

金屬加工與木業工廠最常被抓的就是逸散粒狀物與異味，防制設施在設置許可階段就要對應這兩項。

水：烏溪與濁水溪、搭排專用區與列管結構

南投的水環境以烏溪與濁水溪兩大流域為主，環保局統計污染來源為生活污水、工業廢水、畜牧廢水、農業回歸水與遊憩行為；水污染源列管至 112 年 8 月底共 370 處，含污水下水道系統 34 家與事業 336 家；濁水溪受流域地質條件影響，河水懸浮固體偏高。

廢水去向：

• 南崗與竹山產業園區內廠商循園區污水系統納管；
• 要排入灌溉排水者向農業部農田水利署南投管理處申請，該處設搭排專用區，提供搭排作業指引、申請書、委託書、計畫書與現況說明書、應檢附文件（分一般家戶及農舍與非一般家戶及農舍兩類）、土地使用同意證明書與現場勘查紀錄表；
• 其餘自行處理後依放流水標準排放並取得排放許可。

飲用水方面，環保局對供水量兩萬立方公尺以上的集集、南崗、水里三處淨水場每季稽查一次，位於水源集水區的事業，處理設施會被格外注意。

廢棄物與土壤：掩埋場收費、非法棄置 SOP 與三處場址

南投縣訂有公有掩埋場一般廢棄物及一般事業廢棄物處理收費辦法，一般事業廢棄物在南投有進公有掩埋場的路徑；環保局並公布查獲非法棄置或載運廢棄物標準作業程序與營建產出物混雜適用行政處分原則，營建混合物混入其他廢棄物在南投有明確的處分邏輯。

土壤污染方面，南投截至 114 年 7 月列管三處場址，皆在南投市：一處加油站控制場址（土壤總石油碳氫化合物、地下水苯）與兩處工廠應變必要措施場址（土壤銅、鎳；土壤鉻、鎳），後兩者是金屬加工製程的典型指紋。

金屬表面處理等屬《土壤及地下水污染整治法》公告事業者，在土地移轉、設立或歇業前有評估調查義務，與環保許可一起排。

審查端在看什麼、代價是什麼

南投審查端核對三證時，會把 EMS 基線資料、水措計畫、空污防制計畫與廢清書放在一起比：製程、原物料、產能與廢棄物種類必須一致，土石加工與金屬加工廠的逸散防制設施要在設置許可文件裡有規格與位置。

每年對持證場所製程的抽查，讓證載與現場的落差很快被發現。

代價寫在母法：依《水污染防治法》第45條，未取得排放許可即排放，處新臺幣 6 萬元以上 600 萬元以下罰鍰，主管機關並應令事業全部停工或停業；依《空氣污染防制法》第63條，未取得許可證逕行設置或操作，工商廠、場處新臺幣 10 萬元以上 2,000 萬元以下罰鍰並令停工。

罰鍰在南投同樣向行政科出納繳納；逾期未繳會進入移送執行程序。

自我檢查清單

• 對照三個公告判定要辦哪幾張證，並記下南投環保局各科室的專線與局本部、空污科的不同地址
• 廢清書先在 EMS 取得管制編號、完成基線資料，再列印一式兩份加騎縫章、附設立證明與繳費憑證送收發室
• 確認 PM10、PM2.5 與臭氧皆屬三級防制區的技術要求，土石與金屬加工廠備妥逸散防制設施規格與模式模擬文件
• 定案廢水去向：南崗或竹山產業園區納管、農田水利署南投管理處搭排專用區申請或自行放流
• 委託清運前確認清除處理機構許可效期與項目，展延中的機構要看是否已依限送件
• 營建混合物與一般事業廢棄物去化先對照縣府掩埋場收費辦法與混雜處分原則
• 屬土污法公告事業者同步準備土壤污染評估調查及檢測資料

常見錯誤

• EMS 基線資料隨便填——之後每月申報與聯單都跟基線對不上，變成長期的解釋義務
• 紙本廢清書沒加騎縫章或漏附設立證明——收發室收件後補正，時間全耗在往返
• 以為南投空氣好就不用最佳可行控制技術——南投三項主要污染物皆屬三級防制區，達一定規模的新增源仍須採最佳可行控制技術並模式模擬
• 廢水直接排入灌溉溝渠——未向農田水利署南投管理處申請搭排，也未取得排放許可，兩邊都違規
• 營建混合物混入其他廢棄物——南投有營建產出物混雜適用行政處分原則，混雜就是罰則

官方參考資料

• 《水污染防治法》全文｜全國法規資料庫
• 《空氣污染防制法》全文｜全國法規資料庫
• 南投縣政府環境保護局

常見問題

南投 廢清書 怎麼申請？要送到哪裡？

先在環境部環境保護許可管理資訊系統（EMS）取得管制編號（已有其他類別管編者填傳真單傳真環保局），登入後完成基線資料填報與確認，進入許可申請填寫廢清書，列印一式兩份加騎縫章並用印，附設立證明文件影本，審查費以現金臨櫃行政科或郵政匯票繳納，紙本送南投縣環保局 C 棟二樓收發室或郵寄。

環保局網頁附有廢清書審查流程圖與諮詢專線。

南投 工廠 空污許可 也要最佳可行控制技術嗎？

要看規模。

依環境部 113 年 12 月 31 日公告的各級防制區劃定表，南投縣 PM10、PM2.5 與臭氧皆屬三級防制區；依《空氣污染防制法》第6條，三級防制區內新增或變更達一定規模的固定源應採最佳可行控制技術並經模式模擬證明不超過容許增量限值，既存源則應削減排放量。

金屬加工、土石加工與木業的逸散粒狀物與揮發性有機物，在設置許可階段就要對應防制設施規格。

南投 工廠廢水 可以排進灌溉溝嗎？

要先向農業部農田水利署南投管理處申請搭排。

該處設搭排專用區，提供搭排作業指引、申請書、委託書、計畫書與現況說明書、應檢附文件（分一般家戶及農舍與非一般家戶及農舍兩類）、土地使用同意證明書與現場勘查紀錄表；同時廢水仍要符合放流水標準並依《水污染防治法》第14條取得排放許可。

位於南崗或竹山產業園區者，優先評估園區污水系統納管。

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